县级以上林业主管部门可查封林权证。依据《森林法》和《农村土地承包法》，林权证受法律保护，非法定程序不得查封。若违规查封，将损害权利人的合法权益，影响林地的正常使用和权益实现。
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处理林权证查封问题，常见方式有行政复议、行政诉讼。选择时，需根据具体情况判断，若认为查封行为违法，可通过行政复议或行政诉讼维护权益。
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林权证查封由林业部门执行。应对方式：1.确认查封是否合法，依据《森林法》等核对；2.若不合法，向查封部门提出异议，要求解除；3.异议无果，可申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身权益。